通常情况下，阴囊毛根部起疙瘩、疼的原因有毛囊炎、脂肪瘤、过敏反应等，可以通过生活护理、饮食调理、药物治疗缓解。具体分析如下：
1.毛囊炎：毛囊炎是指毛囊发炎的情况，可能导致疼痛和起疙瘩。患者可以在医生的指导下使用莫匹罗星软膏、夫西地酸钠软膏等药物进行治疗。
3.脂肪瘤：脂肪瘤是一种良性的软组织肿块，通常不疼痛，但是如果发生在敏感区域（如阴囊），可能会引起不适和疼痛。可以通过脂肪瘤切除术治疗。
3.过敏反应：某些刺激物，如摩擦、过紧的衣物、化学品等，可能引起过敏反应，导致阴囊毛根部起疙瘩和疼痛。建议确保持清洁，避免过度刺激，并避免接触过敏的物质。患者可以在医生的指导下使用盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等药物进行治疗。
除以上原因外，还有其他的原因，如皮脂腺囊肿、阴囊炎、粟丘疹，建议及时诊断，对症治疗。建议饮食清淡，注意休息，避免熬夜。